文献类型：期刊文章

作　　者：王琳琳[1] 王颖芳[2] 段广才[1,3] 薛泽润[1] 郭向娇[1] 王鹏飞[1] 郗园林[1] 杨海燕[1]

机构地区：[1]郑州大学公共卫生学院流行病教研室,河南郑州450001 [2]河南科技大学预防医学教研室,河南洛阳471003 [3]新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心,河南新乡453003

出　　处：《微生物学报》

基　　金：国家科技重大专项(2013ZX10004607)~~

年　　份：2015

卷　　号：55

期　　号：4

起止页码：476-483

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】检测志贺菌成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR),并分析其与志贺菌耐药的关系。【方法】根据CRISPR DB数据库公布的志贺菌确定的CRISPR结构序列CRISPR-S2、CRISPR-S4和可能的CRISPR结构序列CRISPR-S1、CRISPR-S3设计四对引物,对60株志贺菌进行PCR扩增。采用CRISPR Finder分析CRISPR,采用改良K-B药敏纸片法检测志贺菌耐药情况,并分析CRISPR-S4与耐药的关系。【结果】确定的CRISPR结构的总阳性率为95%,四个CRISPR位点组成12种CRISPR谱型(A-L),除K型外均含确定的CRISPR结构,新发现1种重复序列和12种间隔序列。60株志贺菌的多重耐药率为53.33%。CRISPR-S4阳性菌株与阴性菌株之间,耐药的分布差异无统计学意义,但多重耐药菌株和耐TE菌株CRISPR-S4的重复序列多为R4.1,其3'末端缺失碱基AC;多重耐药菌株CRISPR-S4的间隔序列多为Sp5.1、Sp6.1和Sp7。【结论】CRISPR在志贺菌中广泛分布。CRISPR重复序列的变异和间隔序列的多样性可能与志贺菌耐药有关。

关 键 词：志贺菌 多重耐药 CRISPR

分 类 号：R446.5]