文献类型：期刊文章

作　　者：孙冬莹[1] 邵冰[2] 张春蕾[3] 李春兰[4] 杜娟[5] 宋波[4] 林元龙[4] 李庆海[6] 岳超[6] 金刚[6] 刘树林[6] 王滨有[1] 王福祥[4]

机构地区：[1]哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病教研室,哈尔滨市150086 [2]吉林医药学院公共卫生学院流行病教研室 [3]哈尔滨市胸科医院检验科 [4]哈尔滨医科大学附属第四医院感染科 [5]吉林医药学院药学院基础化学实验室 [6]哈尔滨医科大学基因组中心,哈尔滨市150086

出　　处：《中华实验和临床感染病杂志（电子版）》

基　　金：黑龙江省自然科学基金(No.H201383)

年　　份：2015

卷　　号：9

期　　号：1

起止页码：14-17

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的了解哈尔滨市男男同性恋者(MSM)感染HIV-1流行株的亚型分布状况及基因变异情况。方法采集MSM人群中HIV感染者血液标本,提取病毒RNA并应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)对HIV病毒gag区基因进行扩增,并对扩增产物测序。Mega 5.1软件进行系统进化树分析及基因离散距离的计算,Bio Edit 7.0.0软件将相应的基因序列翻译成氨基酸并分析其变异情况。结果成功获得61条gag基因序列,亚型分析结果显示,CRF01_AE 49例(80.32%),CRF07-BC 5例(8.19%),B亚型7例(11.47%)。其中B亚型基因离散距离最大(0.078±0.005),CRF01_AE最小(0.051±0.004)。CRF01_AE在MSM人群中形成两个独立的进化簇。各亚型的MHR序列变异对比结果显示,B亚型的中MHR序列中第7位缬氨酸(V)突变为异亮氨酸(I)的比例最大。结论哈尔滨市MSM人群中主要存在CRF01-AE、CRF07-BC和B三种亚型,以CRF01-AE为主要流行亚型;其中B亚型基因变异程度最大。对MSM人群HIV-1流行及变异情况的监测有助于对MSM人群开展及时有效的治疗。

关 键 词：男男同性恋 GAG基因 HIV-1亚型  

分 类 号：R512.91]