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基于线粒体DNA控制区的新疆北鲵种群遗传多样性分析
Analysis of Population Genetic Diversity of Ranodon sibiricus in China Inferred from Mitochondrial DNA Control Region
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]新疆师范大学生命科学学院,新疆特殊环境物种多样性应用与调控重点实验室,新疆乌鲁木齐830054 [2]广东省昆虫研究所,广东广州510260
基 金:新疆维吾尔自治区国际科技合作基金(20126009);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2011211B17)
年 份:2015
卷 号:54
期 号:2
起止页码:194-198
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、INSPEC、JST、MR、PROQUEST、RCCSE、RSC、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊
摘 要:以线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区为分子标记,对分布于新疆温泉县6处自然栖息地的新疆北鲵(Ranodon sibiricus)遗传多样性进行研究.共采集新疆北鲵尾端肌肉组织样本60份,通过PCR扩增获得853bp的mtDNA序列,含D-loop序列747bp、tRNA-Pro序列72bp及部分tRNA-Thr和tRNA-Pro之间基因间隔区(ISR)序列34bp,其中D-loop序列中A、T、G和C 4种核苷酸所占百分比分别为31.92%,35.04%,15.02%和18.02%,A+T所占百分比为66.96%.经MEGA软件比对发现,所得60个样品的扩增序列(853bp)完全一致,共享一个单倍型,所有扩增序列仅在控制区的第449位碱基(均为A)与GenBank(AJ419960)中新疆北鲵线粒体该位点碱基(为G)不一致.结果表明,国内现存6处自然栖息地内的新疆北鲵遗传多样性极低,在近缘同属种及脊椎动物中都极为罕见,显示该种近期经历过严重的瓶颈效应,可能由一个单倍型扩散至目前的分布格局.研究结果可为该物种保护提供分子遗传学依据.
关 键 词:新疆北鲵 线粒体DNA D-LOOP 遗传多样性
分 类 号:Q349.1] Q959.52
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