文献类型：期刊文章

作　　者：周丽霞[1] 肖勇[1] 杨耀东[1]

机构地区：[1]中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌571339

出　　处：《广东农业科学》

基　　金：国家自然科学基金(31101179)

年　　份：2014

卷　　号：41

期　　号：14

起止页码：136-138

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2013_2014、IC、RCCSE、UPD、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：从NCBI网站下载40 728条油棕EST,结合文献报道的油棕果肉转录组序列信息,通过聚类拼接和处理,得到全长为32 637.947 kb的无冗余序列20 054条。在这些序列中共检索出4 538个SSR,检出率为22.6%。其中以单核苷酸重复基序为主导类型,出现频率为51.2%,二核苷酸、三核苷酸重复基序的出现频率分别为20.4%和17.9%。随机挑选了400对SSR引物进行PCR多态性检测,获得29对PCR多态性引物,并随机选取11对引物进行验证,在4种不同来源的油棕样本中表现出多态性。

关 键 词：油棕 转录组 SSR

分 类 号：S565.9]