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气肿疽梭菌细胞毒素CctA基因的克隆及生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of Cytotoxic CctA gene in Clostridium chauvoei
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]延边大学农学院动物医学系,吉林延吉133002 [2]延边州畜牧总站,吉林延吉133000 [3]延边州动物疫病预防控制中心,吉林延吉133000 [4]延吉市动物卫生监督所,吉林延吉133000
基 金:吉林省教育厅"十二五"科学技术研究项目(吉教科合字[2014]第6号)
年 份:2015
卷 号:40
期 号:1
起止页码:82-85
语 种:中文
收录情况:ZGKJHX、普通刊
摘 要:根据GenBank中气肿疽梭菌细胞毒素CctA基因的参考序列,采用PCR方法扩增细胞毒素CctA基因。在将该基因进行克隆和测序后利用生物信息学方法,对细胞毒素CctA蛋白的理化性质、结构功能域、蛋白质二级结构和三级结构及抗原表位等重要参数进行了预测和分析。结果表明:与参考序列(JQ692583)相比,存在3处突变,核苷酸序列的同源性和氨基酸序列的同源性均为99.4%;CctA蛋白的理论等电点为8.00,不存在跨膜区和信号肽序列,二级结构以β-折叠和无规则卷曲为主,主要有4个抗原表位区域。本研究为CctA蛋白功能的深入研究提供了参考,并为气肿疽梭菌单克隆抗体的制备及合成肽疫苗的研发奠定了基础。
关 键 词:气肿疽梭菌 细胞毒素CctA基因 克隆 序列分析
分 类 号:S852.44]
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