文献类型：期刊文章

作　　者：李东萍[1] 郭明璋[1,2] 许文涛[1,2]

机构地区：[1]中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083 [2]中国农业大学食品科学与营养工程学院食品安全检测与风险评估实验室,北京100083

出　　处：《生物技术通报》

基　　金：北京市科技新星计划(XX2014B069)

年　　份：2015

卷　　号：31

期　　号：2

起止页码：71-77

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：16S rRNA测序是高通量测序依赖的肠道微生物研究方法之一,该方法可以对肠道微生物中的所有菌种进行精确定量,因此正逐渐成为研究肠道微生物菌种丰度变化的主流。肠道微生物16S rRNA测序的应用过程中有两个问题至关重要,一是如何根据需要选择测序方案;二是面对高通量测序得到的海量数据,如何进行生物信息学分析,以得到具有生物学意义的结果。从测序平台、测序片段、测序数据量的选择3个方面讨论了如何选择测序方案,并从序列聚类与注释、群落结构分析、关键分类单位的筛选与功能分析等方面对目前常用的生物信息学分析手段进行综述。

关 键 词：肠道微生物 16SrRNA  高通量测序

分 类 号：Q93]