文献类型：期刊文章

作　　者：邓冠华[1] 查龙应[2] 张国霞[2] 王玉[3] 黎耀涛[2] 彭欣[2] 周宏伟[2] 刘移民[1]

机构地区：[1]广州市职业病防治院职业卫生评价检测中心,广州市医学重点学科职业健康监护科,广州市职业环境与健康效应实验室,广州510620 [2]南方医科大学公共卫生与热带医学学院,广州510515 [3]内蒙古自治区赤峰市疾病预防控制中心,内蒙古赤峰024000

出　　处：《生态科学》

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31270152);广东省自然基金面上项目(S2011010004136);广东省教育厅科研处科技创新项目(2012KJCX0031);广州市"121人才梯队工程"后备人才项目

年　　份：2014

卷　　号：33

期　　号：5

起止页码：851-857

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CSCD、CSCD_E2013_2014、核心刊

摘　　要：收集人、大猪、小猪、大鼠、小鼠以及鸡五个不同个体的粪便样品,每个个体取两个平行样,提取总DNA;PCR扩增,获得16S r RNA V6标签片段;Illumina测序;经BIPES以及QIIME分析并比较菌群结构及多样性。研究结果发现,不同物种之间肠道菌群差异较大。五类物种肠道菌群均以厚壁菌门、拟杆菌门、以及变形菌门为主,但鸡的厚壁菌门显著减少,而变形菌门显著增加。从?多样性角度来看,猪肠道菌群种属丰富度及Shannon指数均显著高于人及鸡肠道菌群。从?多样性角度,尽管不同人之间的肠道菌群相似度较低,但不同物种之间相比较,小猪与大鼠肠道菌群与人相似性高于小鼠和鸡肠道菌群。与人类相比,小猪的肠道微生物组最相近,而鸡的肠道菌群相似度最低。

关 键 词：微生物组  Illumina测序  动物模型  微生物多样性 16S  r  RNA  

分 类 号：R372]