文献类型：期刊文章

作　　者：童汪霞[1] 朱建芸[2] 雷姿颖[2] 徐启桓[2] 罗宁[1] 黄小亮[3]

机构地区：[1]柳州市铁路中心医院南方医科大学附属柳州医院,广西545005 [2]中山大学附属第三医院传染病学教研室 [3]平果县人民医院

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》

年　　份：2014

卷　　号：28

期　　号：5

起止页码：336-338

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的 探讨中国丙型肝炎患者中HCV的基因型分布类型,并进行HCV在中国流行病学历史分析,进而研究HCV在中国的分子流行病学和进化动力学特征.方法 从423例丙型肝炎患者的血清中提取HCV RNA并进行cDNA反转录,扩增E1和NS5B两个基因区的核苷酸序列,排除不合格及不适合分析的病毒株序列,再对合格序列进行系统发育分析（phylogenetic analysis）.运用BEAST软件中的Bayesian MCMC （Markov Chain Monte Carlo）算法来进行Coalescence分析,通过重构BSPs（Bayesian skyline plots）图回溯HCV的流行病学历史.结果 HCV分离株的基因分型如下：共包括6个基因型,12个基因亚型（1b：65.9％,6a：17.1％,2a：7.4％,3a：3.6％,3b：3.3％,6e：0.76％,1a,1c,2b,2f,4d以及5a共占0.25％）,以及2个新基因型6变异体.所产生的5个BSP曲线图均凸显1993年至2000年这一时间段,中国的HCV感染数量呈现指数增长,随后则陡然下降.结论 证实了HUV在中国多样性的流行现状,反映了HCV不断变化的基因型流行模式;1993年至2000年期间由于“单采血浆”事件的影响,HCV在中国的感染数量经历了一段“指数”增长期.

关 键 词：肝炎 丙型 贝叶斯定理 流行病学  分子 序列分析  

分 类 号：R512.63]