期刊文章详细信息
炭疽芽胞杆菌中CRISPR位点
Clustered regularly interspaced short palindromic repeats( CRISPR) site in Bacillus anthracis
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]军事医学科学院生物工程研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京100071 [2]兰州生物制品研究所有限责任公司,甘肃兰州730046
基 金:传染病重大专项(2012ZX10004215);国家自然科学基金(81271785,81125012)~~
年 份:2014
卷 号:54
期 号:11
起止页码:1362-1368
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】考察炭疽芽胞杆菌中规律成簇的间隔短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)位点多态性情况及基于CRISPR位点多态性的分子分型方法是否在炭疽芽胞杆菌分型中适用。【方法】下载NCBI数据库中6株炭疽芽胞杆菌基因组并截取其中CRISPR位点片段序列。根据炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点信息,设计相关引物,以193株炭疽芽胞杆菌基因组为模板PCR扩增CRISPR位点片段,测序。本地Blast比对截取序列及测序结果,查看CRISPR位点在炭疽芽胞杆菌中的多态性情况,并比较炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌内CRISPR位点情况。【结果】炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点不存在多态性。【结论】基于CRISPR位点多态性的分子分型方法不适用于炭疽芽胞杆菌分型,但可以用于区分炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌。
关 键 词:规律成簇间隔短回文重复序列 炭疽芽胞杆菌 分子分型
分 类 号:R378]
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