文献类型：期刊文章

作　　者：李晋[1] 陈曦[1] 林效宗[2] 杨欢[1] 张瑞杰[1] 王丽美[3]

机构地区：[1]哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院统计遗传学教研室,150081 [2]哈尔滨医科大学附属第二医院急诊创伤外科,150081 [3]哈尔滨医科大学基础医学院计算机教研室,150081

出　　处：《国际遗传学杂志》

基　　金：基金项目：黑龙江省教育厅科研项目（12531298）

年　　份：2014

卷　　号：37

期　　号：5

起止页码：230-235

语　　种：中文

收录情况：CAS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的 蛋白质相互作用研究对于理解DNA功能、基因组元件作用机制有重要意义.已有大量工作在从蛋白质-蛋白质互作的计算预测方向展开,其中蛋白质-蛋白质互作的特征起着很重要的作用.互作特征的评价及相关数据库构建仍是蛋白质互作预测的一项重要工作.方法 该文从基因、蛋白质序列、功能信息层面提取出人类蛋白质-蛋白质对的27个特征,并应用于多种分类器,利用ROC曲线对特征的性能给出了科学的评价.结果 通过研究发现逻辑回归和贝叶斯网络分类效果最好,生物过程、细胞组分、分子功能、基因表达值、组织、域间互作的可用性明显高于其他特征,同时构建了人类蛋白质互作特征数据库,供广大科研工作者使用.结论 从多角度评价了特征可用性,得到了表现较优的特征,但是对于其中一些特征,还需要进一步提高覆盖率,从而达到更好的效果.

关 键 词：蛋白质-蛋白质互作  机器学习  特征评价  数据库

分 类 号：Q811.4[生物工程类]