期刊文章详细信息
16株中国东北地区临床孢子丝菌菌种分子生物分类学研究
Molecular classification of 16 Sporothrixclinic isolates from Northeast China
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]重庆医科大学附属第一医院皮肤科,重庆400016 [2]重庆医科大学基础医学院基础医学实验教学中心病原生物学与免疫学实验室,重庆400016
基 金:国家自然科学基金(No.31270062);重庆市自然科学基金(No.cstc2011jjA10089)~~
年 份:2014
卷 号:30
期 号:9
起止页码:904-908
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的测定孢子丝菌的基因序列并同参考序列进行系统发育学分析,鉴定孢子丝菌种,探讨准确高效的鉴别菌种的方法。方法提取既往根据组织病理鉴定为申克孢子丝菌的16株临床孢子丝菌株的基因组DNA,利用核糖体内部转录间隔区(Ribosomal Internal Transcribed Spacer,ITS)和部分β微管蛋白(β-tubulin)序列进行PCR扩增,扩增序列同来源于基因库(GenBank)的参考序列进行系统发育学分析。结果基因组DNA分别扩增出约600bp的ITS及约400bp的β-tubulin编码基因,测序后构建的系统发育树分析显示所有的菌株均位于球形孢子丝菌分支上,该16株菌并非申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,S.schenckii),而是球形孢子丝菌(Sporothrix globosa,S.globosa)。结论中国东北孢子丝菌病致病菌可能为球形孢子丝菌或并非只是单一的申克孢子丝菌,分子生物学鉴定方法更为准确,为临床快速有效鉴别孢子丝菌菌种奠定基础。
关 键 词:申克孢子丝菌 球形孢子丝菌 系统发育 鉴定
分 类 号:R379.9]
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