文献类型：期刊文章

作　　者：马蒙[1] 朱军[1,2,3]

机构地区：[1]浙江大学农业与生物技术学院农学系,杭州310058 [2]浙江大学数学系,杭州310058 [3]浙江大学空气污染与健康研究中心,杭州310058

出　　处：《浙江大学学报（农业与生命科学版）》

基　　金：Project supported by the National Basic Research Program of China(973)(Nos.2010CB126006and 2011CB109306);the National Science Foundation of China(No.31371250)

年　　份：2014

卷　　号：40

期　　号：4

起止页码：379-386

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、FSTA、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、UPD、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：基因组学研究的主要目标是剖析复杂性状和疾病的遗传结构.数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位和全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)已经应用于遗传育种和药物研制,分析复杂性状和复杂疾病的遗传结构.本文回顾了分析复杂性状和复杂疾病的QTL定位和GWAS的作图方法和软件.PLINK,TASSEL,SNPassoc,GenABEL和ProbABEL是流行的软件,为GWAS提供了许多有用的功能.PLINK是目前最流行的开源全基因组关联分析的工具集,它聚合了用于分析SNP数据的许多功能.TASSEL是另一种流行的软件,整合了Q+K关联分析的诸多方法.SNPassoc、GenABEL和ProbABEL是应用于关联分析的开源代码R软件包.本文对上述提及的GWAS关联分析流行软件作了简要介绍,并介绍了新研制的QTXNetwork分析软件,它可分析QTL和GWAS定位数量性状SNP(QTS)、数量性状转录子(QTT)、数量性状蛋白子(QTP)和数量性状代谢子(QTM).本文还介绍了一些常用的分析软件,例如Windows QTL Cartographer,QTL Express,Map Manager QTX,R/qtl和QTLNetwork.

关 键 词：复杂性状  连锁定位  关联定位  QTXNetwork软件  

分 类 号：Q939.96]