文献类型：期刊文章

作　　者：樊庆灿[1] 王金玉[1] 张跟喜[1] 唐莹[1] 陈学森[1] 薛倩[1] 王永娟[2]

机构地区：[1]扬州大学动物科技学院,扬州225009 [2]江苏京海禽业集团有限公司,南通226103

出　　处：《农业生物技术学报》

基　　金：国家肉鸡产业技术体系(No.nycytx-42-G1-05);江苏省研究生创新工程(No.CXLX12_0930);江苏省优势学科建设

年　　份：2014

卷　　号：22

期　　号：8

起止页码：1009-1017

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为筛选影响京海黄鸡（Gallus gallus）生长性状的单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism，SNP）标记，寻找影响生长性状的关键基因，本研究利用SNP芯片分型技术，对396只京海黄鸡母鸡的15个SNPs位点直接进行SNP分型，并与京海黄鸡的12个生长指标进行关联分析，对关联分析显著的SNPs进行连锁不平衡分析和单倍型分析。结果表明，15个SNPs中，有9个与至少1个生长性状关联显著（P＜0．05）；9个SNPs中有7个均与多个生长性状关联显著（P＜0．05）。这些SNPs中，rs15497877、rs13972304、rs13553164、rs14917647和rs13973515与生长前期（BW2～BW8）~[J生长后期（BWIO～BW161的体重或日增重关联均为显著（P＜0．05），而rs316142388和rs14917305只与生长后期的体重或日增重关联显著（P＜0．05），rs314214528和rs13553485只与生长前期的体重或日增重关联显著fP〈0．05）；同时，根据这些位点的群体遗传参数，发现9个SNPs的平均多态信息含量偏低，说明京海黄鸡有持续选育提高的可能性和必要性；分析9个SNP连锁不平衡性和单倍型，发现173．5～175．0Mb是一个连锁不平衡区域，具有较高的研究价值，其中，单倍型TTTCCTCAC频率达到32．4％，是十分重要的单倍型；本研究分析部分与关联显著SNPs的最近基因（核质蛋白a3（karyopherin alpha3，KPNA3）、叉头转录因子0亚家族l（forkhead transcription factor group O 1，FOX01）和淋巴细胞白血病缺失7（deleted in lymphocytic leukemia 7，DLEU7））的功能，发现这些基因可以通过不同途径影响鸡的生长性状。研究结果有利于京海黄鸡乃至地方鸡种标记辅助选择的应用。

关 键 词：京海黄鸡 生长性状 全基因组关联分析(GWAS)  单核苷酸多态(SNP)  

分 类 号：S831.2]