文献类型：期刊文章

作　　者：戚文华[1] 蒋雪梅[2] 肖国生[1] 黄小云[1]

机构地区：[1]重庆三峡学院生命科学与工程学院,重庆404100 [2]重庆三峡学院化学与环境工程学院,重庆404100

出　　处：《畜牧与兽医》

基　　金：重庆三峡学院人才引进项目(12RC03);重庆三峡学院科研创新团队(201302);重庆三峡学青年项目(13QN12)

年　　份：2014

卷　　号：46

期　　号：8

起止页码：9-13

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用生物信息学方法搜索猪全基因组中完整型微卫星序列,并对其基因组中微卫星数量、频率以及分布规律进行了研究。搜索到猪全基因组中1-6个碱基重复类型微卫星位点数为1 149 884个,占其全基因组长度的比率为0.85%,出现频率为1/2.22 kb。猪第1条染色体（143 330个）中微卫星数量最多,其次是第2、6和13条染色体,而较少的是第12、18条染色体和Y染色体。猪性染色体X和Y序列长度差异极显著,X染色体序列长度是Y染色体的88.10倍,其微卫星数量也存在明显差异（58 437 vs 814）。通过检验表明,猪染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性（r=0.913,P〈0.01）。猪全基因组中完整型微卫星各重复类型中,单碱基重复类型数量最多,占其微卫星总数量的比率为62.95%;其次依次是二碱基、四碱基、三碱基、五碱基、六碱基重复类型。猪全基因组中微卫星重复拷贝类别数量较多的是A、AC、AT、AAC、AAT、AAAT AAAC、AAAG、AAGG,而数量较少的是C、CG、AGC、AGT、ACT、AGCG、AGTC、ACTG和CCGG。

关 键 词：猪  基因组 微卫星序列 生物信息学

分 类 号：S828]