文献类型：期刊文章

作　　者：初芹[1] 李东[2] 侯诗宇[3] 石万海[4] 刘林[4] 王雅春[2]

机构地区：[1]北京市农林科学院畜牧兽医研究所,北京100097 [2]中国农业大学动物科技学院,畜禽育种国家工程实验室,北京100193 [3]鞍山恒利奶牛场,辽宁114200 [4]北京奶牛中心,北京100192

出　　处：《遗传》

基　　金：国家科技攻关计划项目(编号:2011BAD28B02);现代农业产业技术体系专项资金(编号:CARS-37);长江学者与创新团队发展计划项目(编号:IRT1191);国家自然科学基金项目(编号:31172191)资助

年　　份：2014

卷　　号：36

期　　号：7

起止页码：691-696

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：首先选择139个牛SNP标记,利用DNA池测序法,根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值>1/2);为了进一步验证筛选的准确性,对其中59个标记采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术检测了122头荷斯坦牛的基因型。结果显示,检出率高于85%的标记有56个,其平均最小等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)为0.41,最小值为0.27,最大值为0.5;MAF>0.3的标记有54个,占96.4%(54/56)。文章结果表明,采用DNA池测序法筛选高信息量SNP标记是可行和可信的。

关 键 词：奶牛 DNA池  SNP标记 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术  最小等位基因频率  

分 类 号：S823]