期刊文章详细信息
2013年西安地区柯萨奇病毒A6流行情况及基因特征
Circulation status and genetic characteristics of coxsackievirus A6 in Xi'an in 2013
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西安交通大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,陕西西安710061 [2]西安市卫生局,陕西西安710007 [3]西安市疾病预防控制中心,陕西西安710054
基 金:西安市卫生局科研项目(No.2013052)~~
年 份:2014
卷 号:35
期 号:4
起止页码:486-489
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2013_2014、EMBASE、IC、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 研究2013年西安地区普通手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CA6)的流行情况及其基因特征.方法 从2013年采集的普通HFMD病例标本中随机挑选250份非肠道病毒71型(EV71)非柯萨奇病毒A16型(CA16)的其他肠道病毒核酸阳性者,利用实时荧光逆转录酶联聚合反应检测CA6,扩增部分阳性标本VP1 (viral protein,VP)基因,并测定序列,与CA6其他参考序列比对,进行进化分析.结果 在250份样本中CA6阳性者共191份,阳性率为76.4%.进化分析显示西安地区2013年CA6与近年来流行于世界各地的CA6新变种同源性较高,而与原型株进化距离较远.序列比对发现本地毒株VP1与CA6新变种核苷酸序列相似性在89.7%~97.5%,编码氨基酸相似性为96.0%~99.7%;与CA6原型株及2006年以前中国大陆分离株核苷酸相似性为82.3%~83.8%,氨基酸相似性为93.8%~94.9%.结论 2013年西安地区HFMD普通病例病原以CA6为主,流行株为近年来流行于全球各地的CA6新变种.
关 键 词:手足口病(HFMD) 病原 柯萨奇病毒A6型(CA6) 进化分析
分 类 号:R373.2]
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