文献类型：期刊文章

作　　者：陈宏远[1,2] 谭毅[3] 马伟峰[4] 刘晓[1] 邵方元[1] 符吴萸[1] 芮雯[5]

机构地区：[1]广东药学院基础学病原生物学与免疫学系,广东广州510006 [2]暨南大学生物医药研究开发基地/广东省生物工程药物重点实验室/基因药物国家工程中心,广东广州510632 [3]温州医学院中美糖尿病并发症研究所,浙江温州325035 [4]南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系,广东广州510515 [5]广东药学院中心实验室,广东广州510006

出　　处：《生物技术》

基　　金：国家自然科学基金项目("基于R语言化学计量学方法的蜜炙黄芪炮制机理研究";No.81202917);广东省自然科学基金项目("双靶向CXCR4和HIF-1α抑制乳腺癌生长与转移的实验研究";No.9451022401002931);广州市2014年科技计划("新型抗癌前体药物ZAAN-Dox的合成及药效学研究";No.148)资助

年　　份：2014

卷　　号：24

期　　号：3

起止页码：9-16

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2013_2014、核心刊

摘　　要：目的：克隆人源CXCL12-α的成熟肽编码序列后进行生物信息学分析及其蛋白质结构与功能预测。方法：采用RTPCR方法从人骨髓组织中克隆CXCL12-α基因序列,并将编码其成熟蛋白的核酸片段插入原核表达载体pET-30a（＋）中,转化Escherichia coli后进行酶切鉴定和DNA序列测定。利用在线网络生物信息学相关数据库和分析软件对测序结果进行分析,并对重组蛋白的一、二、三级结构及功能等进行验证和预测。结果：获得了基因序列为263 bp的人源CXCL12-α基因,与GenBank中公布序列一致。双酶切鉴定及DNA测序验证结果正确。生物信息学检索该基因编码蛋白的氨基酸序列与理化参数显示,蛋白无跨膜区,在第29位有一个Ser为蛋白激酶磷酸化位点,第1~21位可能为信号肽区域。ɑ-螺旋,无规则卷曲,延伸链和β-转角数量分别占总二级结构的44.94%、22.47%、21.35%、11.24%。同源建模预测信息可信度为0.68,该蛋白G-factor结构计分总平均为0.33,结构检验表明该蛋白属于正常范围内。二级结构和拓扑结构信息、蛋白质结合位点三维图和预测蛋白可能催化口袋及结合位点、三维结构模拟的可视化结构显示其空间结构稳定。结论：人源CXCL12-α分子克隆成功,网络数据库等生物信息学分析及结合蛋白质结构与功能预测可为深入研究CXCL12-α提供理论指导。

关 键 词：CXCL12-α  分子克隆 生物信息学序列分析  

分 类 号：Q786]