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枫斗类石斛rDNA ITS区的全序列数据库及其序列分析鉴别
DATABASE ESTABLISHMENT OF THE WHOLE rDNA ITS REGION OF DENDROBIUM SPECIES OF “FENGDOU” AND AUTHENTICATION BY ANALYSIS OF THEIR SEQUENCES
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国药科大学生药学研究室,江苏南京210038 [2]南京师范大学生命科学学院,江苏南京210097
基 金:国家自然科学基金资助项目 ( 30 17114 4 )
年 份:2002
卷 号:37
期 号:7
起止页码:567-573
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 建立枫斗类石斛的rDNAITS区碱基全序列数据库 ,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别。方法 对枫斗类石斛的rDNAITS区进行了PCR扩增、测序 ,运用CLUSTRAL ,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNAITS区全序列数据库对待检种rDNAITS区进行序列分析鉴别。结果 建立了 2 1种枫斗类石斛的rDNAITS区全序列数据库 ,枫斗类石斛在该区的种间差异显著而稳定 ,转换和颠换总数为 11~ 12 2 ,变异位点数为 34 1,信息位点数为195。与外类群植物云南石仙桃间的差异较大 ,转换和颠换总数为 131~ 16 1。枫斗类石斛居群间的差异较小 ,转换和颠换总数为 0~ 6。结论 利用枫斗类石斛的全序列数据库及遗传分析软件 ,通过对待检种rDNAITS区进行序列测定 ,可以成功鉴别属于数据库中枫斗类石斛的待检种。
关 键 词:石斛属 枫斗类石斛 rDNAITS区 碱基全序列 DNA分子鉴别
分 类 号:R284[中药学类]
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