文献类型：期刊文章

作　　者：张克斌[1] 金晓琳[1] 朱军民[1] 胡晓梅[1] 饶贤才[1] 胡福泉[1]

机构地区：[1]第三军医大学基础医学部微生物学教研室,重庆市微生物工程重点实验室,重庆400038

出　　处：《第三军医大学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目 (3 0 0 70 0 3 7);重庆市攻关课题资助项目(2 0 0 0 )

年　　份：2002

卷　　号：24

期　　号：4

起止页码：378-380

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的　对新分离的铜绿假单胞菌dsDNA溶原性噬菌体PaP3进行基因组测序。方法　用CsCl梯度离心纯化噬菌体PaP3颗粒 ,提取噬菌体基因组DNA ,建立shot-gun随机文库 ,从文库中随机挑取克隆进行测序并完成序列组装 ,同时通过限制性内切酶图谱结合酶切片段的变性、复性实验分析基因组末端。结果　共进行了 778条序列的测定与拼接 ,测序量达到 1 3 5倍覆盖率 ,得到一条长为 4 42 4 9bp的重叠群 ,此重叠群错误率为 9 4 6ERR 1 0KB ,测序结果和酶切图谱分析表明该PaP3基因组是一 4 42 4 9bp长的线性平端dsDNA分子。其碱基组成为A =2 4 2 4 % ,G =2 6 1 8% ,T =2 3 6 3% ,C =2 5 94 % ;稀有碱基 =0 ;A +T =4 7 87% ,C +G=52 1 3%。结论　噬菌体PaP3基因组是由 4 42 4 9bp组成的线性平端双链DNA分子。测序完成为生物信息学分析和功能基因研究奠定了基础。

关 键 词：铜绿假单胞菌 噬菌体 基因组测序 PaP3  

分 类 号：Q755] Q939.48