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新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析
Analysis of 16S rDNA Sequences and DNA-DNA Hybridization of Moderately Halophilic Bacteria from Xinjiang Region
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业大学生物学院微生物学系,北京100094
年 份:2002
卷 号:42
期 号:2
起止页码:133-137
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:通过数值分类和 1 6SrDNAPCR RFLP分析 ,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究 ,发现了一个新类群。在此基础上 ,进行了中心株AI 3的 1 6SrDNA全序列分析 ,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较 ,得到系统发育树状图。在此树状图中 ,大多数参比菌株聚在一起 ,其 1 6SrDNA全序列的同源性在 96 %以上 ,而AI 3与参比菌株的 1 6SrDNA全序列相比 ,其相似性低于 75 %。但是 ,AI 3与Alcanivoraxborkumensis[1] 的 1 6SrDNA全序列的相似性为 96 % ,与Halobacilluslitoralis的 1 6SrDNA全序列的相似性为 99% ,三者构成一个独立的发育分支。这说明在系统发育上 ,AI 3与参比菌株属于不同的分支 ,是一个新的类群。在新类群内 ,菌株之间的DNA同源性大于 70 % ,而中心株AI 3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonaselongata)的DNA同源性为 44% 。
关 键 词:新疆地区 16S rDNA全序列 DNA-DNA杂交 系统发育 盐湖 嗜盐菌 DNA同源性
分 类 号:Q93-331]
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