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期刊文章详细信息

基于数据挖掘分析FOXO1在成熟B细胞肿瘤中的表达及靶基因预测    

The analysis of FOXO1 in mature B-cell neoplasms and its target genes based on data mining

  

文献类型:期刊文章

作  者:宋慧慧[1,2] 李原[2] 葛峥[1,2] 黄培林[2]

Song Huihui;Li Yuan;Ge Zheng;Huang Peilin(Department of Hematology,the Affiliated Zhongda Hospital of Southeast University,Nanjing 210009;School of Medicine,Internal Medicine,Southeast University,Nanjing 210009,China)

机构地区:[1]东南大学附属中大医院血液内科,江苏南京210009 [2]东南大学医学院,江苏南京210009

出  处:《南京医科大学学报(自然科学版)》

基  金:南京市医学科技发展专项资金资助(YKK15251)

年  份:2018

卷  号:38

期  号:12

起止页码:1692-1695

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的:利用数据挖掘分析FOXO1在B细胞肿瘤中的表达情况,并进一步探讨FOXO1对B细胞肿瘤的影响。方法:利用Oncomine数据库分析FOXO1基因在B细胞肿瘤中mRNA水平的变化。通过BIOGPS分析人体正常组织和其相应的肿瘤组织中FOXO1基因的表达差异。利用GEPIA做FOXO1基因的表达水平与B细胞肿瘤患者生存期的相关性分析。在String-DB数据库中探索FOXO1基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因。结果:与正常组织相比,B细胞肿瘤组织中FOXO1基因在mRNA水平呈低表达,FOXO1基因的表达水平与B细胞肿瘤患者的总体生存时间无明显相关性(Log-rank P=0.39)。EP300、JUN、MYC、STAT1、FOS、SPI1、E2F1等基因与FOXO1有明显或潜在的相互作用。结论:大样本数据挖掘能迅速获取B细胞肿瘤组织中FOXO1表达的相关信息,为探索FOXO1在B细胞肿瘤发生发展中的作用提供科学的理论基础。

关 键 词:FOXO1 数据挖掘 成熟B细胞肿瘤  数据库

分 类 号:R733]

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