文献类型：期刊文章

作　　者：王占军[1] 李豹[1] 姜行舟[1] 欧祖兰[1] 徐忠东[1] 代欢欢[1]

Wang ZhanjunLi Bao;Jiang Xingzhou;Ou Zulan;Xu Zhongdong;Dai Huanhuan(College of Life Science,Hefei Normal University,Hefei 230601,China)

机构地区：[1]合肥师范学院生命科学学院,合肥230601

出　　处：《中国细胞生物学学报》

基　　金：安徽省自然科学基金面上项目(准号:1708085MC76);安徽省高校自然科学基金重点项目(批准号:KJ2015A186);合肥师范学院教学研究项目(批准号:2017jy43)资助的课题~~

年　　份：2018

卷　　号：40

期　　号：12

起止页码：2028-2039

语　　种：中文

收录情况：CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：研究密码子偏好性有利于提高两种茶树外源基因表达水平及探讨遗传进化规律。该研究综合运用CodonW 1.4.2、SPSS 22.0软件以及Perl、Python语言,系统分析两种茶树基因组CDS序列,从而得出密码子偏好模式和高频密码子,明确密码子使用的变异来源。结果表明:两种茶树基因组的密码子偏好性主要受突变压力影响,在一定程度上也受到自然选择等因素的影响;两种茶树基因组倾向于使用以A/T结尾的密码子,且它们在密码子使用模式上具有较高的相似性;"云抗10号"(Camellia sinensis var. assamica, CSA)茶树基因的异源表达受体优先选择拟南芥、毛果杨和烟草,"舒茶早"(Camellia sinensis var. assmica, CSS)茶树基因的异源表达受体首选毛果杨。上述结果为分析两种茶树的进化规律、提高它们基因组中的基因异源表达效率提供了重要依据。

关 键 词：茶树 全基因组 密码子偏好性 异源表达

分 类 号：S571.1] Q943.2]