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期刊文章详细信息

木薯SWEETs基因家族生物信息学及表达特性研究    

Bioinformatics Analysis and Expressional Characteristics of Cassava SWEETs Gene Family

  

文献类型:期刊文章

作  者:薛蓓蓓[1] 覃丽芳[1] 董明右[1] 李有志[1] 樊宪伟[1]

Xue Beibei;Qin Lifang;Dong Mingyou;Li Youzhi;Fan Xianwei(Guangxi University,College of Life Science and Technology,State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Nanning,530004)

机构地区:[1]广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁530004

出  处:《基因组学与应用生物学》

基  金:广西自然科学基金(No.2015GXNSFAA139078);广西高等教育本科教学改革工程项目(2016JGA135)共同资助

年  份:2019

卷  号:38

期  号:1

起止页码:260-268

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:SWEET (sugars will eventually be exported transporters)是植物中新发现的一类编码糖转运蛋白的基因,它在植物生长发育及糖代谢过程中发挥重要作用。该基因家族在木薯(Manihot esculenta)中尚未有详细的报道。本研究从Phytozome数据库获得了28个木薯SWEET候选基因并对其进行生物信息学分析,在华南124的木薯苗中通过荧光定量实验检测SWEET基因在旱胁迫下的表达水平。结果发现木薯SWEET基因被分为4簇,主要分布在第6条和第14条染色体上,编码234 aa与302 aa之间的氨基酸序列;木薯SWEET基因家族的表达在旱胁迫条件下发生了变化,其中明显上调的基因有9个,包括MeSWEET1b、MeSWEET2a、MeSWEET6、MeSWEET9a、MeSWEET9b、MeSWEET12、MeSWEET15a、MeSWEET15b和MeSWEET16c;而表达量明显下调的基因也有9个,为MeSWEET2b、MeSWEET3b、MeSWEET4、MeSWEET7、MeSWEET11、MeSWEET16a、MeSWEET16b、MeSWEET17a和MeSWEET17c。这些结果为进一步阐明SWEET基因家族在木薯中的功能提供理论依据。

关 键 词:木薯 SWEET基因  旱胁迫 基因表达  

分 类 号:S533]

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