文献类型：期刊文章

作　　者：马鹏举[1,2] 周佳熠[1] 孙会改[1] 马丹丹[1] 高飞[1] 周宜君[1] 张根发[2]

MA Pengju;ZHOU Jiayi;SUN Huigai;MA Dandan;GAO Fei;ZHOU Yijun;ZHANG Genfa(College of Life and Environmental Sciences,Minzu University of China,100081,Beijing,China;College of Life Sciences,Beijing Key Laboratory of Gene Resource and Molecular Development, Beijing Normal University,100875,Beijing,China)

机构地区：[1]中央民族大学生命与环境科学学院,北京100081 [2]北京师范大学生命科学学院,抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室,北京100875

出　　处：《北京师范大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31670335,31770363,31470399);抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室开放课题资助项目(201706);国家大学生创新性实验计划资助项目(GCCX2016110019);中央民族大学研究生自主科研基金资助项目(182115).

年　　份：2018

卷　　号：54

期　　号：6

起止页码：733-737

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、INSPEC、JST、MR、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊

摘　　要：好好芭是一种重要的特种油料植物,具有极高的经济价值.由于好好芭基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究以黄瓜和大豆作为内标,用流式细胞仪测定经碘化丙啶(PI)染色的内标细胞核和好好芭细胞核混合样品的PI荧光强度,通过比较好好芭与内标细胞DNA含量峰值的倍数关系,计算好好芭的基因组大小.同时使用基于生物信息学的K-mer分析来估测好好芭的基因组大小.采用流式细胞术测得好好芭基因组大小约为774 Mb.Kmer分析表明,当K值分别为17、19、21时,相应的DNA峰值出现在128、125和123,因此估测jojoba基因组大小为777～794Mb.K-mer分布曲线有明显的杂合峰,说明jojoba基因组杂合度较高.本研究完成了对好好芭基因组大小的估测,可为好好芭基因组学研究提供参考.

关 键 词：好好芭 流式细胞术 K-mer分析  基因组大小

分 类 号：S666.7] R331]