期刊文章详细信息
中日产川芎的matK、ITS基因序列及其物种间的亲缘关系
matK AND ITS NUCLEOTIDE SEQUENCING OF CRUDE DRUG CHUANXIONG AND PHYLOGENETIC RELATIONSHIP BETWEEN THEIR SPECIES FROM CHINA AND JAPAN
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国中医研究院中药研究所,北京100700 [2]国家中药现代化工程技术研究中心,广东珠海519020 [3]河北省药品检验所,河北石家庄050011 [4]富山医科药科大学和汉药研究所药效解析中心
年 份:2002
卷 号:37
期 号:1
起止页码:63-68
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 分析中国产川芎LigusticumchuanxiongHort.及日本产川芎CnidiumofficinaleMakino的核基因组ITS和叶绿体基因组matK序列 ,为探讨中日产川芎物种间的亲缘关系提供分子依据。方法 采用PCR直接测序技术测定川芎和日本川芎的ITS基因和matK基因核苷酸序列并作序列变异分析。结果 川芎和日本川芎的matK序列长度均为 12 68bp ,编码 4 2 2个氨基酸。ITS1 5 8S ITS2序列长度均为 699bp ,其中 18SrRNA基因 3′端序列 5 4bp ,ITS1序列 2 15bp ,5 8SrRNA基因序列 162bp ,ITS2序列 2 2 2bp ,2 6SrRNA基因 5′端序列 4 6bp。根据排序比较 ,川芎原植物与其商品药材间的matK基因和ITS基因序列完全相同 ,而川芎与日本川芎间matK基因则仅有 1个变异位点 ,即在上游 95 9nt处 1个转换替代 (T→C) ,反映在氨基酸序列则发生一个非同义取代V(GTG)→A(GCG) ;ITS基因也仅有 1个变异位点 ,即在ITS1上游 5 4nt处 1个转换替代 (T→C)。结论 通过进化速率较快的基因序列同源性分析 ,基本可以认为中日所产川芎基原一致 ,日本川芎学名似应改为LigusticumchuanxiongHort.
关 键 词:川芎 日本川芎 MATK基因 ITS基因 核苷酸测序
分 类 号:R282.71[中药学类] R282.5[中医学类]
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