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猪O型口蹄疫病毒强弱毒株VP_1基因的克隆与序列分析
Cloning and Sequence Analysis of the VP_1 Gene of Virulence and Vaccine Strains of Foot-and-mouth Disease Virus Type O in Swine
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广东省兽医生物技术重点实验室,广东广州510640
基 金:广东省自然科学基金重大项目 (No96 30 0 7) ;广东省科技攻关项目 (No .99B0 5 6 0 1G) ;广东省农科院院长基金项目 (No96_基金_10 )
年 份:2001
卷 号:23
期 号:5
起止页码:377-381
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:本研究根据口蹄疫病毒 (FMDV)VP1基因的序列 ,设计并合成了 1对用于扩增整个VP1基因的引物 (5P、P6 )。从细胞培养液或组织中提取总RNA ,通过PT_PCR扩增 ,从F2 9株、O3I3株和T5 0 9株中均获得了 1条约 740bp的DNA电泳带。将PCR产物双酶切后电泳回收 ,插入到相应双酶切的pUC18质粒中 ,获得了重组质粒。通过PCR鉴定 ,证明重组质粒pUCVP1/F2 9、pUCVP1/O313、pUCVP1/T5 0 9均插入了VP1基因。对上述 3个重组质粒进行测序后分析 ,F2 9强毒株与O3I3、T5 0 9弱毒株相比 ,其核苷酸序列同源性分别为 98.75 %和 99.0 6 % ;因F2 9株核苷酸发生 3个碱基缺失与 1个碱基替换 ,故推导的氨基酸序列同源性分别仅为 44 .13%和 41.32 % ;而T5 0 9株与O3I3株相比 ,其核苷酸、氨基酸序列同源性分别为 99.37%和 95 .31%。通过序列分析发现 ,本研究的 3个毒株与国内大多数毒株 (包括 1997年台湾暴发FMDV所分离的毒株 ,除O/A/ 5 8株外 )均属于同一基因型 ,核苷酸序列同源性为 85 %~ 94% ;而与国外毒株相比 ,属不同的基因型 ,核苷酸序列同源性仅为 81%~ 82 %。其推导的氨基酸序列 ,除F2 9株与O/HK/ 93株及 1997年台湾暴发FMDV分离的少数毒株的氨基酸序列同源性仅为 45 %~ 6 3%外 ,本研究的
关 键 词:O型口蹄疫病毒 VP1基因 基因克隆 序列测定 猪 强毒株 弱毒株
分 类 号:S858.285.3] S852.659.6[动物医学类]
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引证文献:
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