期刊文章详细信息
双向凝胶电泳-飞行时间质谱法分析人肺鳞癌细胞NCI-H520蛋白质组成分
Analysis of Human Lung Squamous Carcinoma Cell Line NCI-H520 Proteome by Two-Dimensional Electrophoresis and MALDI-TOF-Mass Spectrometry
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,湖南长沙410078 [2]湖南师范大学生命科学院,湖南长沙410081
基 金:中国博士后科学研究基金(中博基[2000] 23号);湖南省科委研究基金(2000年);国家自然科学基金(编号:300000
年 份:2001
卷 号:20
期 号:6
起止页码:575-582
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:建立和优化肿瘤蛋白质组研究的方法系统,并分析人肺鳞癌细胞蛋白质组。方法:用固相 pH梯度双向凝胶电泳分离人肺鳞癌细胞系NCI-H520总蛋白,银染显色,PDQuest 2DE软件分析,对部分蛋白质 点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flying mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)测定其胶内酶解后的肽质指纹图谱,用 PeptIdent软件查询 SWISS-PROT数据库。结果:获得了分辨 率和重复性均较好的双向电泳银染图谱,图像分析探测到3块胶的平均蛋白质点数为(1146±116),平均匹配的点 数为(851±95),匹配率达 73. 7%, 3 块胶在蛋白质点位置上具有较好的重复性, IEF方向的平均偏差为(1. 52± 0.22)mm,SDS-PAGE方向的平均偏差为(1.97 ± 0.13)mm。随机取60个蛋白质点进行胶内原位酶解-质谱指纹图 分析得到了54个蛋白质点的肽质指纹图,查询数据库初步鉴定了44个蛋白质,其中部分是与细胞周期有关的蛋 白,部分是与信号传导有关的蛋白。
关 键 词:双向电泳 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 肺肿瘤 鳞癌细胞 NCI-G520
分 类 号:R734.2]
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