文献类型：期刊文章

作　　者：李雪[1] 胡秀彩[1,2] 兰云[1] 沈晓静[1] 朱爱华[1] 吕爱军[1]

机构地区：[1]江苏师范大学生命科学学院生物技术系,徐州221116 [2]江苏省药用植物生物技术重点实验室,徐州221116

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金(31272692;30800847)资助

年　　份：2014

卷　　号：33

期　　号：1

起止页码：29-35

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2013_2014、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：采用PCR方法扩增嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）外膜蛋白相关基因,即粘附素（Aha）、外膜蛋白A（OmpA）基因全长序列,进行DNA测序及生物信息学分析。结果表明：Aha基因长1 314 bp,推导编码355 aa,5～24 aa区域为跨膜螺旋,26～355 aa区域为革兰氏阴性菌孔蛋白结构域（PF00267）,Aha蛋白三级结构与模板（PDB：1PHO_A）相似性达28.21%;OmpA基因长1 102 bp,推导编码338 aa,含有OmpA跨膜结构域（PF01389）和OmpA结构域（PF00691）,预测OmpA蛋白抗原表位位于64～69 aa、160～171 aa、244～249 aa、259～274 aa和295～301 aa区域,OmpA蛋白三级结构OmpA跨膜结构域和OmpA结构域与模板（PDB：1BXW_A,PDB：4ERH_A）相似性分别为27.45%和57.58%;进一步采用拉马钱德兰图（Ramachandran plot）检测分析,与Aha、OmpA基因蛋白三级结构预测结果一致。本研究有助于理解嗜水气单胞菌致病的分子机制,为鱼类疾病防治及疫苗应用提供科学参考。

关 键 词：嗜水气单胞菌 粘附素 外膜蛋白 序列分析  三级结构  

分 类 号：Q78]