文献类型：期刊文章

作　　者：韩长志[1]

机构地区：[1]西南林业大学林学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224

出　　处：《生物技术》

基　　金：云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目("滇西地区核桃炭疽病菌的防治及多菌灵对其作用机制研究";ZK11A101;"滇西地区核桃炭疽病菌的鉴定及对多菌灵抗药性研究";ZK11SB01;"云南省重点学科森林保护学科研项目";XKZ200905)资助

年　　份：2014

卷　　号：24

期　　号：2

起止页码：36-41

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2013_2014、核心刊

摘　　要：目的：禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病，给农业生产造成了巨大经济损失。分泌蛋白在植物病原菌对植物侵染、定殖、扩展等致病过程中，发挥着重要作用。对禾谷炭疽菌分泌蛋白进行预测，并对其特征进行明确。方法：利用SignalP、ProtComp、TMHMM、big—PIFungalPredictor和TargetP预测程序对禾谷炭疽菌中120006条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻，同时，对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点以及理化性质等进行分析。结果：禾谷炭疽菌含有分泌蛋白为630个，其氨基酸长度多集中于100～600aa之间；信号肽长度以17～20个aa的序列最为集中；信号肽切割位点属于A—X—A类型；分泌蛋白在分子量、等电点、稳定系数方面均存在差异，但大多数分泌蛋白属于亲水性蛋白。此外，上述分泌蛋白中，具有预测功能的蛋白为330个，其功能较多的集中于酶类，包括d一半乳糖苷酶、B一木聚糖酶、p一木糖苷酶等。结论：通过上述生物信息学分析方法有效地实现了禾谷炭疽菌分泌蛋白的预测，分泌蛋白的信号肽切割位点类型与已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉等分泌蛋白信号肽切割位点一致，分泌蛋白功能涉及较多的酶类，也与其他已经报道的病菌分泌蛋白功能相类似。

关 键 词：禾谷炭疽菌  分泌蛋白 信号肽 预测程序  

分 类 号：S436.35]