文献类型：期刊文章

作　　者：冀俊忠[1] 刘志军[1] 刘红欣[1] 刘椿年[1]

机构地区：[1]北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室,北京100124

出　　处：《自动化学报》

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB744601);国家自然科学基金(61375059;61332016);教育部博士点学科专项科研博导类基金(20121103110031);北京市教委科研计划重点项目(北京市自然科学基金重点B类项目)(KZ201410005004)资助~~

年　　份：2014

卷　　号：40

期　　号：4

起止页码：577-593

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CSCD、CSCD2013_2014、EI(收录号：20141917704153)、IC、INSPEC、JST、MR、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘　　要：蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题.本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用;其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述;再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比.最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考.

关 键 词：蛋白质相互作用网络 功能模块检测  检测流程  分类体系  性能对比

分 类 号：Q51] R346[基础医学类]