文献类型：期刊文章

作　　者：张浩文[1] 杨禹丞[1] 鲁志[1]

机构地区：[1]清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室,北京100084

出　　处：《生命科学》

基　　金：国家自然科学基金青年基金项目(31100601);国家自然科学基金面上项目(31271402);国家重点基础研究发展计划("973"项目)(2012CB316503);国家高技术研究发展计划("863"项目)(2014AA021100);IBM基金;Bayer基金;罗氏基金

年　　份：2014

卷　　号：26

期　　号：3

起止页码：219-227

语　　种：中文

收录情况：CSCD、CSCD_E2013_2014、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。

关 键 词：RNA二级结构预测 自由能 共突变  非编码RNA

分 类 号：Q811.4[生物工程类] Q52