文献类型：期刊文章

作　　者：陈慧娟[1] 吴志明[2] 闫若潜[2] 赵雪丽[2] 赵明军[2] 周兵强[2] 孔刚锐[2] 闫志玲[2] 程俊贞[2] 靳利粉[1]

机构地区：[1]河南农业大学牧医工程学院,河南郑州450002 [2]河南省动物疫病预防控制中心,河南郑州450008

出　　处：《中国畜牧兽医》

基　　金：河南省科技攻关计划项目"猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及其致病性研究"(132102110159)

年　　份：2014

卷　　号：41

期　　号：3

起止页码：14-18

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为分析2012年河南省猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异情况，本研究设计合成2对扩增s1基因的特异性引物，利用RT—PCR方法，对2012年分离的5株PEDV毒株的S1基因进行扩增、克隆和序列测定，并对其进行遗传进化分析。结果表明，5株PEDVs1基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98．3％～99．5％和97．1％～98．9％；与2011年以来国内登录的PEDV流行变异株核苷酸同源性为88．6％～98．0％，氨基酸同源性为85．3％～98．7％；与经典毒株cV777核苷酸同源性为88．7％～89．1％，氨基酸同源性为87．3％～88．4％。5株分离株s1基因均存在相同的插入和缺失，与2011年以来国内登录的流行变异毒株相比没有大的变异，但与参考毒株CV777相比，在163l66bp处有3个核苷酸插入；在l73l74bp之间有9个核苷酸插人；在405—406bp之间有3个核苷酸插入；在463464bp之间有3个核苷酸缺失，这些位点核苷酸的插入和缺失导致了其编码的氨基酸相应改变。s1基因系统进化树分析结果表明，5株分离株与2011年以来国内登录的流行变异毒株均属于基因Ⅲ群，与2011年国内登录的少部分PEDV基因Ⅰ群流行毒株的核苷酸同源性为88．6％～89．3％，氨基酸同源性为85．3％～86．9％，而经典毒株CV777所在分支群属于基因Ⅱ群。本试验结果表明，2011年以来，中国流行的PEDV毒株中同时有基因Ⅲ和Ⅰ群的存在，但以基因Ⅲ群毒株为主，其致病性和抗原性差异仍有待进一步研究。

关 键 词：猪流行性腹泻病毒 S1基因 遗传变异  分析  

分 类 号：Q78]