文献类型：期刊文章

作　　者：蓝贤梅[1] 黄艳[1] 崔颖[1]

机构地区：[1]哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院系统生物学教研室

出　　处：《哈尔滨医科大学学报》

基　　金：哈尔滨医科大学大学生创新基金项目校B级

年　　份：2014

卷　　号：48

期　　号：1

起止页码：36-39

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的研究人类CD4+T细胞全基因组核小体抑制和激活状态下的定位模式,转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)分布特征以及两者之间的关系。方法采用生物信息学软件R、Java等通过编写比对算法进行统计学分析。结果人类CD4+T细胞中核小体定位在染色质上的分布比例为0.6,从休眠到激活状态核小体定位发生位置改变,呈现稳定定位模式和动态定位模式,且比例分别为2%和98%,核小体定位具有较大的动态变化性;核小体定位与TFBS位置关系研究中,发现分布在核小体内的TFBS数目较大,但总体长度较短;而分布在连接DNA上的TFBS数目相对较少,但总体长度较长。结论人类CD4+T细胞休眠和激活状态下全基因组的核小体定位模式基本一致,核小体定位与TFBS关系有明显特征。

关 键 词：核小体定位 CD4+T细胞 转录因子结合位点 定位模式  

分 类 号：R39[基础医学类]