文献类型：期刊文章

作　　者：刘峰[1,2] 谢玲玲[3] 弭宝彬[1] 欧阳娴[1] 茆振川[2] 邹学校[1] 谢丙炎[2]

机构地区：[1]湖南农业科学院蔬菜研究所,长沙410125 [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081 [3]湖南农业科学院西瓜甜瓜研究所,长沙410125

出　　处：《园艺学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(31101425);国家重点基础发展计划项目(2009CB119000);国家现代产业技术体系建设专项资金项目(CARS-25-B-01);公益性行业(农业)科研专项(2011303018)

年　　份：2014

卷　　号：41

期　　号：2

起止页码：343-348

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用SNP分析软件从辣椒(Capsicum annuum L.)251 068条Unigenes中筛选出18 159个SNP,其中有1 781个SNP位点被匹配在1 291个注释基因上,基因功能分类和代谢途径分析表明,其中有853个基因参与初生代谢(28.7%)、细胞代谢(17.3%)、生物合成过程(15.7%),另有125个(9.7%)基因序列参与新陈代谢途径,53条(4.1%)序列参与次生代谢产物合成途径,31条(2.4%)序列参与植物激素合成途径。EST-SNP序列中4 172条(22.9%)满足设计CAPS引物条件,为了验证EST-SNP正确性,并选取了15对CAPS引物对5份辣椒材料进行扩增,结果发现有8对(53.3%)引物表现出多态性。表明筛选出这些EST-SNP标记可作为辣椒基因分型、图谱构建等的候选分子标记。

关 键 词：辣椒 转录组 EST-SNP  CAPS

分 类 号：S641.3]