文献类型：期刊文章

作　　者：刘仲娜[1] 钟金城[1] 柴志欣[1] 马志杰[2] 曾贤彬[1] 宋乔乔[1]

机构地区：[1]西南民族大学,动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室,四川成都610041 [2]青海大学畜牧兽医科学院,青海省放牧家畜营养与生态国家重点实验室培养基地,青海高原牦牛研究中心,青海西宁810016

出　　处：《中国畜牧兽医》

基　　金：国家科技支撑计划课题(2012BAD13B06)!

年　　份：2013

卷　　号：40

期　　号：12

起止页码：5-11

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：SRY是Y染色体上具体决定生物雄性性别的基因片段,是多数哺乳动物性别决定基因之一。本试验采用克隆测序SRY基因并结合生物信息学对其序列进行分析,利用软件Codon W分析麦洼牦牛、普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡和人该基因编码区的密码子偏好性。克隆测序得到SRY基因序列含1个690bp的开放阅读框,共编码229个氨基酸;其编码区核苷酸序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99.9%、93.9%、91.2%、76.5%、43.3%、21.4%、69.1%。经聚类分析,麦洼牦牛首先与普通牛聚在一起,绵羊与山羊聚为一类,这两类相聚后再依次与猪、人、小鼠相聚,最后与鸡聚为一类,其结果与以往的生物学分类结果一致。该基因编码的蛋白质分子式为C1155H1827N351O348S11,相对分子质量为2655.0,理论等电点PI为9.55,亲水性平均数为-0.855。其密码子偏好性分析显示,T3s为0.2905、C3s为0.3240、A3s为0.3728、G3s为0.2963,第3位碱基中出现G和C占第3位碱基总量的48%,同义密码子数为61。上述数据表明麦洼牦牛SRY基因编码序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、人具有较高的一致性,在物种进化过程中较为保守。该基因对含A的密码子有较高的偏爱性,尽量避开以G结尾的密码子,且其所编码的蛋白质为亲水性蛋白。

关 键 词：麦洼牦牛 SRY基因 聚类分析 密码子偏好性

分 类 号：Q78]