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期刊文章详细信息

常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰    

A bird's eye view of the algorithms and software packages for reconstructing phylogenetic trees

  

文献类型:期刊文章

作  者:张丽娜[1] 荣昌鹤[2] 何远[1] 关琼[3] 何彬[3] 朱兴文[1] 刘佳妮[3] 陈红菊[4,3]

机构地区:[1]大理学院数学与计算机学院,云南大理671003 [2]云南林业职业技术学院,云南昆明650224 [3]中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,计算生物学与医学生态学研究组,云南昆明650223 [4]红河学院,云南蒙自661100

出  处:《Zoological Research》

基  金:遗传资源与进化国家重点实验室"开放课题"(项目名称:利用生存分析改进系统发育树和溯祖树构建的准确性和可靠性;项目编号:GREKF11-11)

年  份:2013

卷  号:34

期  号:6

起止页码:640-650

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、DOAJ、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:系统发育树又称进化树、生命树等,在达尔文的"进化论"一书中首次出现,之后系统发育树的重构被广大生物学家所接受。该文阐述了构建系统发育树的基本流程,对目前用于构建系统发育树的四类算法(距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)进行了详细地分析和比较,并介绍了一些常用系统发育树构建和分析软件(PHYLIP、MEGA、MrBayes)的特点。

关 键 词:系统发育树 距离矩阵法  最大简约法 最大似然法 贝叶斯算法 系统发育分析软件  

分 类 号:TP301.6] Q11[计算机类]

参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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