期刊文章详细信息
常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰
A bird's eye view of the algorithms and software packages for reconstructing phylogenetic trees
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]大理学院数学与计算机学院,云南大理671003 [2]云南林业职业技术学院,云南昆明650224 [3]中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,计算生物学与医学生态学研究组,云南昆明650223 [4]红河学院,云南蒙自661100
基 金:遗传资源与进化国家重点实验室"开放课题"(项目名称:利用生存分析改进系统发育树和溯祖树构建的准确性和可靠性;项目编号:GREKF11-11)
年 份:2013
卷 号:34
期 号:6
起止页码:640-650
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、DOAJ、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:系统发育树又称进化树、生命树等,在达尔文的"进化论"一书中首次出现,之后系统发育树的重构被广大生物学家所接受。该文阐述了构建系统发育树的基本流程,对目前用于构建系统发育树的四类算法(距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)进行了详细地分析和比较,并介绍了一些常用系统发育树构建和分析软件(PHYLIP、MEGA、MrBayes)的特点。
关 键 词:系统发育树 距离矩阵法 最大简约法 最大似然法 贝叶斯算法 系统发育分析软件
分 类 号:TP301.6] Q11[计算机类]
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引证文献:
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同被引文献:
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