文献类型：期刊文章

作　　者：戚文华[1] 蒋雪梅[2] 肖国生[1] 黄小云[1] 杜联明[3]

机构地区：[1]重庆三峡学院生命科学与工程学院,重庆404100 [2]重庆三峡学院化学与环境工程学院,重庆404100 [3]四川大学生命科学学院,四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室,成都610064

出　　处：《畜牧兽医学报》

基　　金：国家973项目(2012CB722207)

年　　份：2013

卷　　号：44

期　　号：11

起止页码：1724-1733

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2013_2014、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：本研究利用MSDB v2.4搜索牛和绵羊全基因组中完整型微卫星序列,并对其进行生物信息学分析。牛基因组共统计了806 272个微卫星位点,其微卫星数量最多的是第1条染色体,其次是第2、3、4、5、6条染色体,数量较少的是第25和28条染色体。绵羊基因组共统计了682 891个位点,其微卫星数量最多的也是第1条染色体,其次是第2、3条染色体和X性染色体,数量较少的是第24、25、26条染色体。通过检验表明,牛和绵羊染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性(r>0.80,P=0.000)。牛和绵羊基因组中单碱基重复类型微卫星数量最多(45.33%vs 44.42%),其次依次是二碱基>三碱基>五碱基>四碱基>六碱基重复类型。牛和绵羊基因组中微卫星重复拷贝类别数量较多的是A、AC、AT、AGC、ACG、AAC、AAT、AAAT、AAAC和AAAG,而其数量较少的是C、CG、AGT、CCG、ACT、AACG、AAGC、AACC、AACT、ACCG、AGCT、AGCG、CCGG和CCCG。

关 键 词：牛  绵羊 基因组 微卫星序列 生物信息学

分 类 号：S823] S826]