期刊文章详细信息
碎米桠及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究
Molecular authentication and phylogenetic relationship of Isodon rubescens and its relatives
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心,河南郑州450002
基 金:国家自然科学基金面上项目(31070171;31270236);科技部国家星火计划项目(2012GA750004)
年 份:2013
卷 号:44
期 号:20
起止页码:2904-2909
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2013_2014、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的构建碎米桠Isodonrubescens及其与近缘种之间系统发育关系,准确鉴别碎米桠及其近缘种。方法提取碎米桠及其近缘种DNA,对核基因ITS片段和叶绿体基因psbA-trnH序列扩增和测序,计算物种种内、种间Kimura2-parameter(K2P)遗传距离。采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining(NJ)系统聚类树3种方法进行鉴定分析。结果ITS和psbA-trnH分子系统树支持碎米桠5个居群样本聚为一单系分支,支持率为94%和68%;其中,碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜聚在一支,支持率为70%和51%;溪黄草和显脉香茶菜构成姐妹群分支,支持率为81%和63%。碎米桠及其近缘种种间ITS和psbA—trnH序列的K2P遗传距离为0.00708~0.07261和0.00806~0.02476,均远大于碎米桠种内的遗传距离0~0.00176和0~0.00268。结论碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜亲缘关系较近,溪黄草和显脉香茶菜亲缘关系最近。ITS和psbA-trnH序列可以准确鉴别碎米桠及其近缘种。
关 键 词:ITS psbA—trnH 碎米桠 鉴定 亲缘关系
分 类 号:R282.12[中药学类]
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