期刊文章详细信息
铁皮石斛实时定量PCR内参基因的筛选
Reference Gene Selection for Real-Time Quantitative PCR Analysis of Dendrobium officinale
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国医学科学院-北京协和医学院药用植物研究所,北京100193 [2]陕西中医学院药学院,陕西省中药基础与新药研究重点实验室,西安712046
基 金:国家自然科学基金资助项目(31070300;31101608);陕西省青年科技新星计划项目(2012KJXX-44)
年 份:2013
卷 号:48
期 号:19
起止页码:1664-1668
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的筛选铁皮石斛(Dendrobium officinale)实时定量PCR(real time quantitative PCR,qPCR)最佳内参基因。方法采用同源克隆法、RT-PCR分离候选内参基因;qPCR分析基因的引物扩增效率及相对表达量;geNorm分析内参基因的表达稳定性;qPCR检测法呢基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)基因的表达模式。结果分离到铁皮石斛ACT-1、ACT-2、EF-1α、GAPDH、β-TUB、18S rRNA、26S rRNA等7个候选内参基因片段,引物扩增效率分别为2.12、1.98、2.03、2.08、1.97、2.18和2.05;geNorm分析表达稳定性大小为EF-1α/18S rRNA﹥ACT-1﹥ACT-2﹥GAPDH﹥β-TUB﹥26S rRNA;以EF-1α/18S rRNA为标准分析FPS基因的相对表达量大小为种子>根>原球茎>茎>叶。结论确定珍稀濒危兰科药用铁皮石斛qPCR分析的最佳内参基因,为基因表达研究提供依据。
关 键 词:铁皮石斛 内参基因 定量PCR 基因表达
分 类 号:R931]
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