文献类型：期刊文章

作　　者：赵蕾[1] 陈敬贤[1,2] 王明丽[1]

机构地区：[1]安徽医科大学基础医学院微生物学教研室,安徽合肥230032 [2]哥伦比亚大学病理与细胞生物学教研室,美国纽约10032

出　　处：《中华疾病控制杂志》

基　　金：国家自然科学基金(30872253);安徽省科技厅科技攻关项目(8010302179)

年　　份：2013

卷　　号：17

期　　号：6

起止页码：480-483

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、EMBASE、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA10)VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况。方法对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析。结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%。其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%。它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%～99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%～97%。其中与中国株HQOO5431同源性为96%～97%,与中国株JN639887同源性为96%～97%,与中国株FJ598089同源性为95%～96%,与日本株AB282808同源性为85%～86%,与日本株AB162743同源性为87%～89%,与CoxA10原型株Kowalik(AF081300)同源性为77%～78%。进化分析表明这三株分离株与Kowalik株聚成一簇,均属于CoxA10,与日本各地分离的CoxA10的病毒核苷酸差异较大,但与我国本土分离株自成一簇。结论 2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CoxA10 VP4与中国地区分离株在进化上密切相关,其序列未发生明显变异。

关 键 词：手足口病 柯萨奇病毒感染 序列同源性

分 类 号：R512.57]