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华南地区猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其S基因抗原表位片段的遗传变异分析
Isolation and analysis of genetic variation the major antigenic epitope sequence of S gene of porcine epidemic diarrhea virus in South China
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学兽医学院广东省人畜共患病重点实验室,广东广州510642 [2]广东大华农动物保健品股份有限公司,广东新兴527400
基 金:国家自然科学基金(31072138)
年 份:2013
卷 号:49
期 号:5
起止页码:3-5
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、RCCSE、核心刊
摘 要:应用RT-PCR方法对华南地区某大型猪场疑似猪流行性腹泻病料检测,选取阳性病料接种到Vero细胞,命名为CH/GDGZ/2012(简称GD-12)株。用病毒RNA抽提物为模板,对GD-12的S基因抗原区片段的扩增、克隆后进行核苷酸测序。序列分析表明,CH/GDGZ/2012与CV777、Chinju99、Br1/87、DR13和SM98的核苷酸序列同源性分别为96.9%、93.0%、95.7%、96.7%和96.0%,氨基酸序列的同源性分别为97.7%、91.5%、95.4%、98.0%和94.8%。进化树分析结果显示,华南地区CH/GD-01/2011、CH/GDGZ/2012、GDHSY/2011、CH/GXQZ/2011毒株与经典毒株的遗传距离较大,处于不同的亚群。研究表明,PEDV GD-12株已发生遗传变异、关键抗原表位发生较大变化,该研究可为诊断和防控该病提供参考。
关 键 词:猪流行性腹泻 S基因 变异
分 类 号:S858.28]
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