期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]复旦大学附属华山医院感染科,上海200040 [2]复旦大学附属华山医院皮肤科真菌室
基 金:“十二五”国家科技重大专项资助项目(2013ZX10004612-007)
年 份:2013
卷 号:31
期 号:3
起止页码:138-143
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的评价核糖体RNA基因(rDNA)分子鉴定用于常见致病性真菌鉴定的准确性。方法选取致病性酵母类真菌、丝状真菌和无绿藻共60株,其中包括13株标准菌株和47株临床/环境分离株,分别对其进行表型鉴定和rDNA分子鉴定,包括内转录间隔区1(ITSl)、内转录间隔区2(ITS2)及28S亚基rDNA5’端的D1/D2区(D1/D2)靶序列的测定与比对,比较表型鉴定及单个、多个rDNA靶序列分子鉴定的准确率。结果在23株酵母类真菌分离菌株中,D1/D2分子鉴定准确率最高(20/23,87.0%),而后依次为ITSl联合ITS2(19/23,82.6%)、单用ITS2(18/23,78.3%)、单用ITSl(14/23,60.9%);在22株丝状真菌分离菌株中,ITSl联合ITS2分子鉴定准确率最高(16/22,72.7%),而后依次为ITsl(15/22,68.2%)、ITS2(14/22,63.6%)、D1/D2(13/22,59.1%)。而ITSl、ITS2、D1/D2三者线性联合鉴定准确率更高,可准确鉴定91.3%(21/23)的酵母类真菌分离菌株和72.7%(16/22)的丝状真菌分离菌株。结论rDNA分子鉴定应用于常见致病性真菌的鉴定准确率高,尤其是ITS联合D1/D2具有较好的应用前景。
关 键 词:RNA 核糖体 基因 真菌 序列分析 DNA
分 类 号:R]
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