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期刊文章详细信息

尿液标本淋球菌多抗原序列分型研究    

Neisseria gonorrhoeae multi-antigen sequence typing using urine samples

  

文献类型:期刊文章

作  者:陈绍椿[1] 尹跃平[1] 施美琴[1] 戴秀芹[1] 韩燕[1] 王宝玺[1] 陈祥生[1]

机构地区:[1]中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所,中国疾病预防控制中心性病控制中心参比实验室,南京210042

出  处:《中华皮肤科杂志》

基  金:国家自然科学基金(81101294);国家十一五“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项“防治性病对预防艾滋病的作用研究”(2008ZXl0001-005)

年  份:2013

卷  号:46

期  号:5

起止页码:324-327

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的探讨江苏常州、扬州,广西梧州、贺州,海南三亚、琼海,广东江门、茂名淋球菌多抗原序列分型(NG—MAST)的型别分布。方法88份淋球菌核酸检测阳性的男性性病门诊就诊者(MSP)的尿液标本,用Qiagen试剂盒提取DNA,并进行2次PCR扩增porB、出加基因片段,扩增成功的标本测序后登陆NG—MAST网站进行序列比对,获取菌株基因型别信息。结果对88份阳性标本提取DNA进行单次PCR,扩增porB、tbpB基因的效率分别为13.6%和14.8%,共有12份标本比对成功,得到菌株基因型别,分型效率为13.6%(12/88);进行2次PCR扩增后,porB、tbpB基因的PCR扩增效率分别为71.6%和72.7%,分别增长了58.0%和57.9%,共有62份标本比对成功得到菌株基因型别,分型效率为70.5%(62/88),分型效率提高了56.9%。62份标本共分出45个基因型,其中40个型为已知型别,5个为新型别。所有型别中,STl866型丰度最高,有6份标本为此型别,STl972、ST3356各有4份标本,都集中于江苏项目点。ST532有3份,集中于广东项目点。ST2221有2份,集中于广西项目点,其余各基因型均只有1份标本,散在分布于各省。5个新型别为:porB基因型为892、tbpn基因型98%相似于46型的标本,且丰度较高,仅发现于江苏项目点;porB基因型为903、tbpB基因型99%相似于958型;porB基因型为130、tbpB基因型96%相似于504型;porB基因型为2790、a,pB基因型99%相似于32型;porB基因型为1053、tbpB基因型99%相似于856型。结论尿液标本可以用于NG—MAST分型研究,2次PCR扩增可以提高尿液标本的分型效率,不同地区淋球菌NG—MAST型别表现为多样性。

关 键 词:奈瑟球菌 淋病 基因型 淋球菌多抗原序列分型  

分 类 号:R446.5]

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