文献类型：期刊文章

作　　者：孙伟[1] 李达[1] 苏锐[1] 马月辉[2] 关伟军[2] 张有法[3] 陈玲[3] 吴文忠[3] 周洪[4]

机构地区：[1]扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009 [2]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193 [3]苏州市畜牧兽医站,江苏苏州215200 [4]徐州市睢宁县林牧渔业局,江苏睢宁221200

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：中国博士后科学基金特别资助项目(200902154);科技部家养动物种质资源平台;江苏高校优势学科建设工程资助项目;江苏省农业科技支撑计划项目(BE2012331);江苏省六大人才高峰项目;江苏省工程技术研究中心项目(BM2012308)

年　　份：2013

卷　　号：46

期　　号：8

起止页码：1725-1735

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】克隆绵羊YAP1基因cDNA并分析其序列及其蛋白的遗传特性及其在不同组织中不同程度的表达情况。【方法】以湖羊为研究对象,利用RT-PCR和RACE技术获得绵羊YAP1序列,并结合生物信息学方法对绵羊YAP1的序列进行深入分析。【结果】从湖羊背最长肌中克隆YAP1基因的全长cDNA序列;利用生物信息学技术,对绵羊YAP1基因与其它物种的同源性,蛋白质序列的跨膜区,亚细胞定位,亲水性,潜在信号肽剪切位点,糖基化位点,磷酸化位点,编码产物进行功能预测分析,及其编码蛋白的二级结构,三级结构等进行分析。【结论】克隆获得绵羊YAP1基因序列全长为1 712 bp,包括1 212 bp的编码区序列,编码403个氨基酸。同源性分析发现,绵羊YAP1核苷酸序列与推测氨基酸序列与灰仓鼠的同源性最高,分别达到78.77%和92.51%,而与人、黑猩猩的一致性差异较小。氨基酸序列分析发现该基因编码蛋白为水溶性蛋白,相对分子量为44079.0Da,理论等电点为4.91,无信号肽序列和跨膜区;亚细胞定位主要在细胞核,不属于分泌蛋白;预测含有33个磷酸化位点,7个糖基化位点,具有两个WW结构域,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构显示,YAP1结构域区构成弯曲状螺旋结构。预测YAP1蛋白主要在调节功能过程中有着关键作用。以上研究为进一步探讨YAP1基因在肌肉生长过程中的功能研究奠定了遗传信息基础。

关 键 词：绵羊 YAP1  克隆 生物信息学 表达  

分 类 号：S826]