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口蹄疫病毒一步法TaqMan-MGB荧光定量RT-PCR检测方法的建立
Development of TaqMan-MGB fluorescence quantitative RT-PCR assay for detection of foot-and-mouth disease virus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]四川农业大学动物医学院猪病研究中心,雅安625014 [2]四川省动物疫病预防控制中心,成都610041 [3]四川省畜牧科学研究院,成都610066
基 金:公益性行业(农业)科研专项(No.201203056)~~
年 份:2013
卷 号:29
期 号:4
起止页码:380-384
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的建立一种能快速、高效、敏感、特异地检测口蹄疫病毒(FMDV)的一步法荧光定量RT-PCR检测方法。方法根据FMDV聚合酶3D基因序列比对结果,设计特异性引物和MGB探针;通过优化,得到最佳反应体系和反应条件;分别以质粒和病毒RNA为模板,构建标准曲线;并进行特异性、敏感性、重复性试验。结果该方法能特异性检测A型、O型、Asia 1型FMDV,而对猪瘟、猪蓝耳病、猪圆环病毒、猪细小病毒、猪狂犬病毒、猪乙型脑炎等病原检测结果均为阴性;构建的荧光定量标准曲线Ct值与模板浓度呈良好的线性关系,检测质粒的敏感性可达83.4copies/μL,检测病毒RNA的敏感性可达7.1fg/μL,比多重RT-PCR敏感性高10倍;对4份样品进行5次批内和批间重复检测,检测结果变异系数均小于2%。结论建立的口蹄疫病毒一步法TaqMan-MGB荧光定量RT-PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,可用于口蹄疫临床样品诊断、流行病学调查和畜产品安全监测。
关 键 词:口蹄疫病毒 TaqMan-MGB 荧光定量RT—PCR
分 类 号:R373]
参考文献:
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