文献类型：期刊文章

作　　者：江龙凤[1] 甘霖[1] 李珊山[2] 冯艳艳[3] 姜薇[4] 段亚平[5] 陈敬贤[1,6] 王明丽[1]

机构地区：[1]安徽医科大学微生物学教研室,合肥市230032 [2]吉林大学白求恩第一医院皮肤科,长春市130021 [3]新疆维吾尔自治区人民医院皮肤科,乌鲁木齐830000 [4]北京大学附属第三医院皮肤科,北京市100191 [5]西藏大学医学院基础部,拉萨850000 [6]哥伦比亚大学病理与细胞生物学教研室,纽约市10032

出　　处：《病毒学报》

基　　金：国家自然科学基金(30872253);安徽省科技厅科技攻关项目(8010302179)

年　　份：2013

卷　　号：29

期　　号：2

起止页码：112-118

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为进一步了解我国不同地区流行的水痘—带状疱疹病毒(VZV)病毒株的基因型分布和分析代表性病毒株gE基因序列。于2010年12月至2011年6月期间,收集来自北京市、长春市、拉萨市和乌鲁木齐市4个地区水痘和带状疱疹患者的疱疹液拭子和皮肤痂片,共计18份。用单个核苷酸多态性(SNP)谱的方法确定病毒株的基因型。然后采用聚合酶链反应(PCR)方法扩增gE基因的全长片段,并进行测序分析。SNP分析显示18个病毒株的基因型共为4种,其中有7株属于clade2遗传支,1株属于clade3遗传支,4株为clade5遗传支。另有6株病毒兼有不同遗传支的特征,按照目前国际通用的分型方法不能归属于任何明确的遗传支。对不同病毒株gE基因序列分析,除了发现3个国外已有报道的1个同义突变(T660C)和2个反义突变(C119T、C1606A),还发现了3个新的反义突变(C56T、C1109T和C917A)和4个同义突变(C54T、T1075C、T816C和G279A)。首次在我国新疆自治区发现了clade5遗传支的VZV,在长春市还发现了目前尚未能分型的6株病毒。对部分病毒株gE基因序列分析,在gE的e1和c1抗原表位的编码区内中检出1个新型反义突变(C917A),需要进一步研究该突变对该病毒免疫原性和致病性的影响。

关 键 词：水痘-带状疱疹病毒 基因型 gE糖蛋白  单个核苷酸多态性  同义突变  反义突变  

分 类 号：R373.1]