文献类型：期刊文章

作　　者：范晓军[1] 宋志芳[1] 仙笑笑[1] 李瑶[1] 赵秋勇[1]

机构地区：[1]太原理工大学化学化工学院生物与制药工程系,太原030024

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金项目(31101490);山西省青年科技研究基金(2010021031-2);太原市大学生创新创业计划项目(10074)资助

年　　份：2013

卷　　号：32

期　　号：1

起止页码：91-96

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2013_2014、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：本文从生物信息学角度对克隆获得的金纹细蛾几丁质酶进行分析,通过课题组提交到GenBank的数据,采用在线分析及相应软件分析预测金纹细蛾几丁质酶(LrCHI)基因核苷酸和氨基酸序列的组成、理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、疏水性、二级结构和三级结构等,并构建系统发育树。结果表明:LrCHI开放阅读框由1737bp组成,推导578个氨基酸;此序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族,其N端含有信号肽和几丁质酶18家族活性位点,C端为几丁质结合区,无跨膜结构域区域;预测LrCHI为亲水性蛋白;金纹细蛾与鳞翅目的棉铃虫、甜菜夜蛾进化关系最近。分析结果可为LrCHI的科学研究提供有价值的信息,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据。

关 键 词：金纹细蛾 几丁质酶 生物信息学分析 理化性质 系统发育树

分 类 号：S188]