文献类型：期刊文章

作　　者：刘镭[1] 黄亮[2] 车清海[3] 赵恩宏[2] 黄旭[2] 程露阳[1] 肖丽君[1]

机构地区：[1]承德医学院基础医学部免疫教研室,河北承德067000 [2]承德医学院附属医院肿瘤诊治中心,河北承德067000 [3]吉林市龙潭区妇幼保健院妇产科,132000

出　　处：《重庆医学》

基　　金：河北省人口与计划生育委员会资助项目(2009-B21);河北省卫生厅资助项目(20090579)

年　　份：2013

卷　　号：42

期　　号：3

起止页码：243-245

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2013_2014、IC、JST、PUBMED、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能。方法使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因。生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱。RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达。结果筛选出差异表达基因FAM83A。发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大。预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序。二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲。RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达。结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点。

关 键 词：乳腺肿瘤 生物信息学 SAGE库  FAM83A  

分 类 号：R737.9]