文献类型：期刊文章

作　　者：常新[1] 周剑惠[1] 刘桂艳[1] 王爽[1] 魏雷雷[1] 曹凤瑞[1] 李大强[1] 周凤岩[2] 康建彪[2] 刘红[3] 阴媛[3] 齐中[4]

机构地区：[1]吉林省疾病预防控制中心,吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]吉林市疾病预防控制中心,吉林吉林132000 [3]长春市疾病预防控制中心,吉林长春130033 [4]白城市疾病预防控制中心,吉林白城137000

出　　处：《中国疫苗和免疫》

基　　金：国家科学技术"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"重大专项传染病监测技术平台项目"辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究"课题"吉林省传染病病原谱流行规律研究"子课题(编号:2009ZX10004209-003);吉林省卫生厅2010年拔尖创新人才培养对象资助经费

年　　份：2012

卷　　号：18

期　　号：6

起止页码：536-540

语　　种：中文

收录情况：CAS、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type16,CVA16)VP1编码区的基因特征。方法 对2009年分离于吉林省部分HFMD来源的15株CVA16分离株的VP1编码区基因,进行逆转录-聚合酶链反应扩增,并对扩增产物进行序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1编码区基因进行基因遗传进化及同源性分析。结果吉林省2009年15株CVA16分离株有86.7%(13/15)属于B1a基因亚型,13.3%(2/15)属于B1b基因亚型,并且15株分离株分属于3个相对独立的传播链(Clade1～3),分别由11株、2株、2株组成。3个传播链各自的组内核苷酸和氨基酸同源性均较高,其中较大优势传播链(Clade1)的核苷酸和氨基酸同源性均高达98.2%～100.0%,两个较小传播链均高达100%。结论吉林省2009年监测到至少有2个基因亚型、3个传播链的CVA16引起的HFMD流行,并且呈现以1个B1a基因亚型的优势传播链为主,其他2个小传播链为辅的传播模式。无论是优势传播链还是小传播链,均各自呈现密切的亲缘关系。

关 键 词：手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1编码区 基因特征

分 类 号：R373.11] R183-3[基础医学类]