文献类型：期刊文章

作　　者：李纪勤[1] 包振民[1] 李玲[1] 胡晓丽[1]

机构地区：[1]中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室,山东青岛266003

出　　处：《中国海洋大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家重点基础发展计划项目(2010CB126406;010CB126402);国家高技术研究发展计划项目(2012AA10A402;2012AA10A405);中国海洋大学水生生物种质资源标准化及资源共享项目资助

年　　份：2013

卷　　号：43

期　　号：1

起止页码：56-63

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊

摘　　要：EST(表达序列标签)数据库发掘是单核苷酸多态性标记(SNP)开发的重要途径。本研究利用栉孔扇贝转录组测序数据进行SNP筛选,在含有4条EST以上的18 780条contig(拼接序列)中,共获得21 813个候选SNP位点。利用高分辨率熔解曲线结合非标记探针技术,对其中90个位点在4个野生群体中进行了位点多态性检测。得到33个(36.7%)具有二等位基因位点,并对其中26个位点进行了功能注释。进一步的标记验证显示,33个多态位点在青岛野生群体的48个个体中均成功分型,其观测杂合度Ho和期望杂合度He的分布范围分别为0.062 5～0.744 7和0.099 8～0.504 6,其中5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,各位点间没有检测到连锁不平衡。研究为栉孔扇贝群体遗传学和遗传育种分析提供了候选标记。

关 键 词：栉孔扇贝 单核苷酸多态性 表达序列标签 高分辨率熔解曲线中图法  

分 类 号：S511.03] Q75]